Vind een matchende parent in een referentielijst

Met deze functie is met mogelijk om van een taxon een parent in de TWN-lijst te vinden die in een lijst met referentie-taxa voorkomt. Dit kan bijv. nuttig zijn als het taxon een ondersoort is van een soort die in een beoordelingssysteem voorkomt. De functie kan dan worden gebruikt om de soortenlijst geschikt te maken voor een beoordelingssysteem.

Usage

match_parent(taxa, ref_taxa, n_parents = 5, verbose = FALSE)

Arguments

taxa: Een vector met taxa
ref_taxa: Een vector met referentie-taxa
n_parents: Het aantal parentniveau's dat gecheckt wordt. Default is 5.
verbose: Als TRUE geeft the functie een message met de taxa waar geen match voor is.

Value

Een vector met taxa die in de lijst met referentie-taxa voorkomen.

Als de soort in de referentie-taxa wordt gevonden, dan wordt deze geretourneerd.
Als de soort niet, maar wel een parent is gevonden in de lijst met referentie-taxa wordt deze geretourneerd.
Als de soort of parent niet is gevonden in de lijst met referentie-taxa wordt NA geretourneerd.

Examples


ref <- c("Bufonidae", "kameel")
namen <- c("Bufo calamita", "Bufo", "Bufonidae", "Bufo bufo", "Buf", NA, "zebra")

match_parent(namen, ref)
#> [1] "Bufonidae" "Bufonidae" "Bufonidae" "Bufonidae" NA          NA         
#> [7] NA