krw_mafy_ekr_ss.Rd
Deze functie voert de KRW-toetsing uit voor de macrofyten-soortensamenstelling voor een of meerdere monsters. De toetsing is gebaseerd op de maatlatten uit het jaar 2018.
krw_mafy_ekr_ss( df, krwwatertype.code, biotaxon.naam, abundantieklasse, verbose = FALSE )
df | Een dataframe met macrofyten. Als het dataframe meerdere monsters bevat
moet dit dataframe een grouped dataframe worden met de functie |
---|---|
krwwatertype.code | Naam van de kolom met de KRW-watertype code |
biotaxon.naam | Naam van de kolom met de taxonnamen. |
abundantieklasse | Naam van de kolom met de abundantieklassen van het betreffende taxon. De abundantieklasse dient de waarde 1, 2, of 3 te bevatten. De functie AANVULLEN kan worden gebruikt om om te rekenen naar abundantieklassen. |
verbose | Logical. Als |
Een dataframe met groepkolommen (alleen indien van toepassing), het watertype en:
ekr_ss_mafy
- de EKR voor de soortensamenstelling
ekr_ss_hydrofyten
- de deel-EKR voor de soortensamenstelling hydrofyten (alleen sloten en kanalen)
ekr_ss_helofyten
- de deel-EKR voor de soortensamenstelling helofyten (alleen sloten en kanalen)
De kolomnamen van de kolommen met taxon, watertype en waarde kunnen zowel met als zonder quotes ("") worden ingevoerd door het gebruik van non-standard-evaluation (NSE).
Het is van belang dat de biotaxonnamen in de TWN-lijst voorkomen. De KRW-watertypecode dient overeen te komen met de codes uit de codes uit de aquo-standaard.
if (FALSE) { # Een enkel monster krw_mafy_ekr_ss(df_1_monster, watertype, taxon, abundantie) krw_mafy_ekr_ss(df_1_monster, "watertype", "taxon", "abundantie") # Meerdere monsters in 1 dataframe grouped_df <- group_by(df_meerdere_monsters, meetpunt, datum) krw_mafy_ekr_ss(grouped_df, watertype, taxon, abundantie) # of met het pipe-teken (%>%) df_meerdere_monsters %>% group_by(meetpunt, datum) %>% krw_mafy_ekr_ss(watertype, taxon, abundantie) }